Un completo plano de
la leucemia, con las 'rutas' moleculares que sigue la enfermedad y las
funciones de su genoma. Eso es lo que ha conseguido 'cartografiar' un equipo de
investigadores del Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi i Sunyer
(IDIBAPS) de Barcelona, abriendo la puerta a una mejor comprensión y abordaje
de este cáncer.
Los científicos han
conseguido describir el epigenoma completo de la leucemia linfática crónica, el
tipo de leucemia más frecuente, y han comparado las peculiaridades de las células
que componen ese 'mapa' con el de las células sanas, lo que ha sacado a la luz
algunos de los 'trucos' que emplea la enfermedad para hacerse fuerte.
En concreto, han
identificado unas 500 regiones en el genoma cuya función se altera en la
leucemia. De hecho, los investigadores han comprobado cómo muchas de ellas
cambian su perfil para contribuir directamente a la expansión del trastorno.
"Hemos podido ver cómo las leucemias son capaces de crear una
infraestructura molecular muy eficiente para provocar un crecimiento
descontrolado" de células malignas, explica Iñaki Martín-Subero, jefe del
grupo de investigación en Epigenómica Biomédica del IDIBAPS, coordinador del
trabajo, y que además es también
profesor asociado en la Universidad de Barcelona.
Según Martín-Subero,
está investigación es la primera que consigue proporcionar un mapa completo de
las funciones del genoma del cáncer a gran resolución. "Hasta ahora, los
análisis sólo arrojaban resultados parciales, que no permitían saber cuál era
la regulación de la enfermedad. Porque conocer la secuencia del genoma o sólo
algunas capas del epigenoma no permite saber cómo funciona", aclara el
investigador, cuyo equipo ya consiguió hace unos años la secuencia completa del
genoma y el metiloma de la leucemia.
Tras más de cinco
años de trabajo y gracias a técnicas de bioinformática, el equipo -en el que
han participado 51 investigadores de 23 organismos de seis países diferentes-ha
conseguido ampliar la información disponible y ha podido describir 10 capas de información
epigenética, lo que hace posible vislumbrar una panorámica clara del plano que
sigue la enfermedad.
El trabajo, publicado
en Nature Medicine (https://www.nature.com/nm/
), se ha realizado con la colaboración del Centro de Supercomputación de
Barcelona y utilizando herramientas de secuenciación de última generación, así
como técnicas avanzadas de biología computacional. Han sido necesarios dos años
sólo para la recopilación de la información y otros tres para el estudio de un
volumen de datos tan masivo, explica Martín-Subero.
BIG DATA
En total, los
investigadores han identificado 12 funciones diferentes en el mapa del genoma
de la leucemia. Pero, además, han podido comprobar que son sólo tres grupos de factores
de transcripción los que ponen en marcha la "revolución molecular"
que supone la leucemia.
"Son sólo tres
familias de proteínas quienes se encargan de construir todo ese entramado
industrial que se genera donde antes sólo había un desierto", señala
Martín-Subero.
Toda la información
recopilada tiene, para el científico, "un potencial tremendo", ya que
abre la puerta a nuevos tratamientos que puedan revertir las alteraciones
funcionales de la leucemia.
Por un lado, apunta,
se abre la vía terapéutica de explorar fármacos epigegeticos que permitan dar
marcha atrás a los cambios detectados en esas 500 regiones del genoma que se
alteran con la leucemia.
Pero, además, también cabe la posibilidad de
actuar frente a esas tres familias de proteínas que son quienes encienden la
mecha de la enfermedad. En ese sentido, ya existen fármacos en desarrollo que
han mostrado buenos resultados para inhibir la acción de al menos una de esas
familias.
"Todos los datos
que hemos hallado están disponibles, en abierto para los equipos que en todo el
mundo están trabajando en esta línea", añade Martín-Subero.
El equipo catalán ya
trabaja, entre otras áreas, en la definición de la estructura tridimensional de
este tipo de cáncer así como en la identificación del mapa funcional de otros
trastornos hematológicos.
Fuente: El Mundo.es