El Laboratorio de Virus Respiratorios
del Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) junto con el grupo de investigación en Enfermedades Hepáticas del Vall d'Hebron Instituto de Investigacion (VHIR), ha realizado la secuenciación completa del nuevo coronavirus
SARS-CoV-2 gracias al uso de muestras respiratorias de pacientes procedentes de
diferentes áreas de España.
Esto se suma a los trabajos realizados
por la Universidad de Valencia y la Fundación Fisabio que consiguieron
secuenciar los tres primeros genomas en pacientes españoles infectados por el
nuevo patógeno.
Nueve “clados”(*) distintos
(*) Clado es denominado en biología
como la rama de un árbol filogenético que agrupa seres tanto vivos como
extintos de especies emparentadas desde un antepasado común.
Los análisis bioinformáticos del
laboratorio han concluido que las secuencias del SARS-CoV-2 se agrupan en 9
‘clados’ distintos. Los ‘clados’ son grupos filogenéticos que definen la
evolución biológica de un organismo. En ellos se pueden observan las
diferencias genéticas de los coronavirus circulantes de todo el mundo, que
explican cómo actúa y se comporta. Según han determinado los investigadores del
CNM, las secuencias españolas del SARS-CoV-2 se han relacionado en 3 ‘clados’
diferentes, denominados S, G y V.
Asociación entre secuencias de
Andalucía y Reino Unido
El estudio de secuenciación se llevó a
cabo directamente en muestras de pacientes de País Vasco, Madrid, Andalucía,
Castilla-La Mancha, Castilla y León, Cataluña y Galicia. Esto permite observar
un mapa de la circulación y características de circulación del virus por toda
España.
Asimismo, el análisis permite
caracterizar cómo se relacionan las diferentes secuencias publicadas hasta el
momento, tanto entre sí como con secuencias internacionales, y aporta nuevo
conocimiento sobre la circulación del virus a nivel autonómico y nacional.
También revela informaciones más concretas, como la ubicación de secuencias
procedentes de Andalucía en un ‘clado’ distinto al del resto de secuencias
españolas. Estas muestras se asocian filogenéticamente con secuencias
procedentes de virus analizados en pacientes ingleses.
El desarrollo y la validación de
nuevos métodos de secuenciación masiva permitirán aumentar el número de
secuencias españolas disponibles en las bases de datos procedentes de todas las
comunidades autónomas. Haber logrado esta secuenciación del SARS-CoV2 también
facilitará el estudio de pequeños cambios específicos del virus, comprender
mejor su difusión y circulación, y conocer más en profundidad sus
características genéticas.
Fuente: Gacetamedica.com
